1.综合防治。种子处理。对番茄种子苗木，严格检疫，杜绝病菌传入。选用抗病丰产品种。 温汤浸种。将种子在凉水中浸泡10分钟，再将种子放入55℃温水中浸种30分钟，不断搅拌，并随时补充热水，然后将种子捞出后放入凉水中，室温条件下浸泡4~5小时。 干热处理。将充分干燥的种子放入70℃恒温箱中灭菌72小时（一般含水量低于4％）。 药剂浸种。将种子用40℃左右的温水浸泡3~4小时，之后放入1％高锰酸钾溶液中浸泡10~15分钟，捞出冲洗干净，以防出现药害。也可用5％盐酸浸种5~10小时或1.05％次氯酸钠浸种20~40分钟、硫酸链霉素200毫克／升浸种2小时后冲净，晾干后催芽。 药剂拌种。利用拌种器，将种子与种子质量0.3％的20％盐酸吗啉胍·铜可湿性粉剂混拌均匀后播种。 2.农业防治。合理轮作。与大蒜、葱、韭菜等非茄科植物轮作2年以上，可有效降低田间病原菌的数量，控制病害的发生。 深翻土壤。收获后对土壤进行翻耕，土壤深层有较多的微生物种类，这些微生物会抑制番茄溃疡病菌的生长或加速附着在病残体和土壤表面的病菌死亡。 苗床处理。使用新苗床或采用营养钵育苗，旧苗床用40％甲醛30毫升兑水3~4升消毒，用塑料膜盖5天，揭开后过15天再播种。 土壤处理。可在夏天高温季节进行闷棚处理，对大棚中的土壤灌足水后覆盖聚乙烯膜，日晒4~6周，能有效降低田间菌量，可使番茄溃疡病的发病率降低72％；或者是选用威百亩在定植前1个月对土壤进行熏蒸处理，也可起到良好的预防效果。 清洁田园。及时摘除下部的老、黄、病叶，清洁田园。及时拔除病株和附近的植株，将病残体集中到一起进行焚烧或深埋；并对病穴和周围的土壤施生石灰消毒，或用1克链霉素加水15公斤浇土，避免病菌随病残体传播蔓延。 科学整枝。早上叶片湿度大、露水多时，不要进行整枝、采摘等农事操作，避免病菌粘附在操作人员的身体或操作工具上进行传播。 加强肥水管理。及时排除田间积水，有条件的可进行膜下滴灌，降低室内湿度。或采用自控电热增温等设施控制昼夜温度的变化，减少病菌繁衍和侵染。 高温闷棚。番茄溃疡病的病菌在53℃条件下10分钟，可以致死。利用高温季节密闭温室15~20天，可杀死土壤中残留的病菌，防止病害传播。 3.生物防治。发病初期使用3％中生菌素可湿性粉剂600倍液对植株整体喷雾，每隔3天喷施1次，连续3~4次可有效预防和控制番茄溃疡病的发生和发展。也可用2％春雷霉素水剂500倍液，每隔5~7天喷洒1次，连续使用3~4次。 4.化学防治。苗床与整个生长期都应进行药剂保护。发病前喷洒1∶1∶200波尔多液。定植时，用硫酸链霉素每支兑水15升浇灌幼苗。植株未发病时，可用72％硫酸链霉素可溶性粉剂4000倍液或新植霉素4000倍液、88％水合霉素可溶性粉剂1500~2000倍液、20％叶枯唑可湿性粉剂600~800倍液、20％噻菌铜悬浮剂1000~1500倍液、20％喹菌酮水剂1000~1500倍液、50％氯溴异氰尿酸可溶性粉剂1500~2000倍液、77％氢氧化铜可湿性粉剂500倍液、36％三氯异氰尿酸可湿性粉剂1000~1500倍液、14％络氨铜水剂300倍液、50％琥胶肥酸铜可湿性粉剂500倍液、60％琥·乙膦铝可湿性粉剂500倍液、47％春雷·王铜可湿性粉剂800倍液、12％松脂酸铜乳油500倍液等药剂交替喷雾预防。每7~10天1次，连施3~4次。中心发病区，可用上述药剂灌根。 发病初期，可使用中生菌素可湿性粉剂600倍液50毫升+有机硅（1袋）兑水15公斤，下午2时以后用药。3天用药1次，连用2次，即可控制病情。 还可用33.5％喹啉铜悬浮剂800倍液+72％农用高效链霉素3000倍液、32.5％苯甲·嘧菌酯1500倍液+77％氢氧化铜700倍液+68％精甲霜·锰锌700倍液、20％噻唑锌悬浮剂300~500倍液+12％松脂酸铜乳油600~800倍液灌根防治。